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如何看質粒圖譜?這4大要素缺一不可!
閱讀:56 發(fā)布時間:2021-7-7在生物科研這個領域里,很多小伙伴都會接觸到質粒這個小東西,而當你費盡千辛萬苦后找到這個小東西的圖譜時,你就會發(fā)現(xiàn)圖譜上有很多亂七八糟的箭頭,還有很多英文的序列,比如像什么ORI啊,Amp啊等等,那這些東西究竟是什么意思呢,今天小編就在這里為大家詳細解答一番。
首先要為大家介紹下質粒圖譜包含的四大要素
1.復制起點:控制著質粒的復制,并決定了質粒的宿主和拷貝數(shù)
2.篩選標記:多為抗性基因,以便加以檢測篩選
3.多克隆位點:外源基因的插入位點
4.其他元件:如轉錄調控元件、翻譯表達元件和蛋白標簽等
以下就用大家常用的pcDNA3.1(+)表達載體作為案例
第一步:了解質粒圖譜中的復制起點
如上圖譜中的ori表示質粒的復制起點。質粒的復制起點決定了質粒的宿主及質粒的拷貝數(shù)相關。若圖譜上只有一個ori,表示質粒是原核克隆及表達質粒。而圖譜上有兩個ori,則表示該質粒是穿梭質粒,既可以在原核也可以在真核中復制。
第二步:了解質粒圖譜中的篩選標記
圖譜中的AmpR、KanR等表示質粒載體中的篩選標簽,多為抗生素抗性基因,方便后續(xù)通過抗生素篩選陽性克隆。只存在單抗性的質粒多為原核克隆載體和原核表達載體。而存在兩種或以上的抗性的多為穿梭質粒。
第三步:了解質粒圖譜中的多克隆位點
圖譜中的MCS區(qū)或者許多內切酶集中的部分,就是質粒的多克隆位點。多克隆位點為一系列限制性內切酶酶切位點,是外源DNA的插入位點,一般可通過酶切后連接的方式將外源DNA插入質粒。多克隆位點一般位于轉錄啟動和轉錄終止信號之間。
第四步:了解質粒圖譜中其它元件
質粒載體中除復制起始位點、篩選標記、多克隆位點外,還具有其他一些表達或調控元件,如轉錄調控元件、翻譯調控元件和融合表達標簽蛋白等。比如:
蛋白純化標簽蛋白:His-Tag,GST-tag等
蛋白檢測標簽蛋白:Myc-Tag,F(xiàn)lag-Tag,HA-Taq等
熒光蛋白表達標簽:GFP,mCherry等